金庸曾经有过三段婚姻，1948年与杜治芬结婚，后离婚，1956年再娶。第二任妻子名为朱玫，新闻记者出身，生二子二女。1976年金庸与朱玫感情破裂，主动提出离婚，并娶年轻29岁的林乐怡为妻。
金庸第一任妻子杜冶芬，相识于1947年的杭州，当时金庸在《东南日报》工作，因主编幽默副刊而与杜冶芬的弟弟杜冶秋认识。金庸编理《咪咪博士答客问》栏目，杜冶秋写了一封信去。金庸于是登门拜访，邂逅了17岁的杜冶芬。
金庸随后应聘于《大公报》担任国际电讯编辑。金庸被公派南下香港前夕，他匆忙赶到杭州，正式向杜家提亲。1949年的早春，两人的婚礼在上海举办。婚后不久，杜冶芬也去了香港，杜冶芬因为不会粤语无法找工作，生活过得不愉快。1953年两人办理了离婚手续。
1956年5月1日，金庸再次走进了婚姻殿堂，第二任太太朱枚外表典雅而秀丽。她毕业于香港大学，有很高的英语水平，而且意志坚强，是一个敢打敢拼、风风火火的事业型知识女性。
与次妻创办《明报》
1959年，夫妇俩合作创办了《明报》，金庸任主编，朱枚是唯一的女记者，工作紧张而又艰苦。当时朱枚除了照顾4个孩子，几乎每天从家中送饭给金庸。《明报》王国颇具规模的成功之时，他们的婚姻却出现了裂痕。
朱玫后来发现丈夫有外遇。有传金庸主动提出离婚，但朱玫也提出两大离婚条件，才肯答应跟金庸离婚：一是金庸付一笔钱作为补偿；二是该女侍应要去扎输卵管，才可与金庸结婚。朱玫要这位女侍应扎输卵管，是为她的孩子着想。因为朱玫跟金庸已生了数名子女，若女侍应又有孩子，她的子女一定会被忽视，之后便与朱玫正式离婚。
朱枚随后在孤独和贫困中度过余生，1998年11月8日病死在香港湾仔律敦治医院，年仅63岁。金庸曾经脸带愧色地说过：“我对不起朱枚，我作为丈夫并不成功，我心里感觉对不起她！”
金庸现任妻子林乐怡，容貌清丽脱俗，比金庸年轻29岁。再婚后，金庸曾送小娇妻到澳洲留学。辞去《明报》集团董事长后，金庸始终保持着低调的生活准则。有人问金庸如何经营“忘年之交”的婚姻，他笑着说:“虽然例子不多，但还是可以的，最重要的是互相尊重。平时她什么都很迁就我，到她发脾气时，我便忍住不回嘴。跟她的关系不算特别成功，又不算很失败，和普通夫妻一样。”
长子自杀 心中永远的痛
在金庸的儿女中，大儿子查传侠大概是最具有父亲遗传基因的孩子了。传侠还在牙牙学语时，金庸就开始教他《三字经》。传侠4岁时能背诵全本《三字经》，6岁时背诵《增广贤文》，大家都叫他“小神童”。
金庸对查传侠的感情很深，认为这个儿子有可能会像自己一样，文采出众，以后也会继承自己的事业。查传侠11岁时，就开始发表文章，他的作文《我的人生是为了什么》，令班主任印象深刻。
查传侠和母亲的关系不好，因为朱玫经常大发脾气，动辄和丈夫吵闹，也听不进儿子的多次苦劝，以至于有一段时间查传侠不再理她。目睹了父母的不和后，查传侠觉得自己生活在这样一个家庭里很悲哀，对人生充满了种种悲观的想法。
查传侠14岁时写过一篇文章，说人生大苦，了无意味，有出世思想。有人看过后说应该阻止孩子这样想问题，金庸却觉得儿子是对的，他甚至夸奖儿子早慧，思想深刻。金庸万万没有想到，儿子因“早慧”而断送了性命。1976年10月，正在美国读大学一年级的查传侠因为与女朋友在电话里吵了几句，一时冲动，自缢而亡。那一年，他还不满20岁。
这是金庸心中永远无法弥合的伤痛。关于查传侠自杀的原因，有种说法是与父母离婚有关。2004年9月，金庸曾痛苦地回忆：“我记得接到大儿子在美国过世的消息后，好灰心，好难过；但那天还要继续在报馆写社评，一面写就一面流泪，一直都很伤心，还是要写。”后来，金庸亲自把儿子的骨灰捧回香港安葬。
次子当美食指导 女儿是小龙女原型
金庸的二儿子叫查传倜，有一个体态圆浑的光头，长得酷似金庸。后来，金庸送传倜去英国读书，他选读了会计，他认为“会计只要将数字填入固定的框框便会算出答案，最适合懒人读”。回香港后，金庸把他调到自己的明河出版社当副经理，做些出版管理方面的工作。
因为对川菜、粤菜、印度菜、法国菜很有研究，查传倜师承金庸好友蔡澜，目前在深圳一家高级酒楼当美食指导。很快，查传倜吃出了名。于美食有心得之后，他便师承美食家兼专栏作家蔡澜，为报章杂志写食评，自号“八袋弟子”。所谓“八袋”是指柴、米、油、盐、酱、醋、茶、酒，意思是要尝尽天下美食。
大女儿双耳失聪
2001年初，“食家菜”餐馆在香港开张了。为了鼓励儿子，金庸独自一人来到餐馆“捧场”。香港巨星级人物比如张国荣、梅艳芳、沈殿霞都曾到他的餐馆吃饭。
金庸《神雕侠侣》中的“小龙女”一名曾经是属于他的大女儿查传诗的，金庸以“小聋女”称呼她。貌美聪颖的传诗5岁时，金庸带着妻子儿女到新加坡暂避奔波中，传诗着凉高烧不退，一家小医院医生给她打了一针庆大霉素，导致双耳失聪。
1982年，金庸将传诗送到加拿大多伦多市的约克大学就读。1988年5月，查传诗嫁给了当时的《明报晚报》总编辑赵国安。如今，查传诗已经是3个孩子的妈妈，现在是在中国一家财经电台当总监。
小女儿查传讷从树仁书院毕业，然后比姐姐还早一年出嫁，嫁给了医生吴维昌，育有两个女儿一个儿子，家庭生活幸福美满。
据倪匡爆料，“小龙女”原型不是长女查传诗，而是金庸的小女儿查传讷。查传讷从小喜欢画画，有这方面的天赋，也很勤奋。2011年5月查传讷在香港视觉艺术中心举办了个人画展，金庸曾亲临现场，剪彩捧场。
